南通市第二人民医院是一所集医疗、保健、教学、科研、预防为一体的二级甲等综合性医院，现为南通大学医学院教学医院，南通市“十佳医院”，南通市、通州市职工医疗保险定点医院，国家级爱婴医院。医院开放床位360张，职工487人，其中主任医师15名，副主任医师33名，具有中级职称141人。医院年门诊量近15万人次，出入院6000人次。

　　南通市第二人民医院医疗设备先进齐全、医院环境清新优雅、住院条件舒适安静、服务质量高效一流。院内布局合理，开设八个病区、二十二个临床二级专科及洁净手术室、产房、ICU、CCU等。医院拥有一批先进水平的大中型医疗设备，如螺旋CT、DSA、数字化X光摄影机、数字胃肠机、乳腺钼钯机、彩色B超、全自动生化分析仪、特种蛋白分析仪、化学发光仪、血气分析仪、各种纤维内窥镜、腹腔镜、椎间盘镜、胆道镜、膀胱镜、血透机、呼吸机、全能麻醉机、高压氧舱等现代化诊断治疗设备。病区内装备有中央空调、中央吸引、中央监护，每间病室均设有独立卫生间、闭路电视、外线电话及壁橱家具等标准设施，院内四季绿树成荫、鲜花盛开、喷泉假山错落有致。同时，医院为塑造服务品牌，首家推行了“医疗服务满意工程”，真正实现医院环境“园林化”、病房“宾馆化”、设施“现代化”、服务“人性化”。
　　南通市第二人民医院开设有南通市脑血管病康复中心、乳腺病诊治中心、椎间盘镜诊疗中心，与南京鼓楼医院合作开展心脏病诊治中心，与英国皇家矫形外科协会合作成立科灵国际骨关节病及人工关节置换中心，并与江苏省肿瘤医院建立长期技术协作关系。同时，医院积极对外拓展，先后与周边乡镇30多家基层卫生院建立业务合作。
　　南通市第二人民医院注重引进和开展先进技术，努力加强专科建设，形成众多独具特色的医疗技术，如：苏北地区首家开展椎间盘镜微创手术治疗腰椎间盘突出，乳腺外科乳腺癌的早期检查和系列治疗，神经内科在全市唯一开展脑中风的早期康复治疗，心内科开展冠脉造影、支架植入、射频消融等介入技术治疗冠心病及心律失常，妇产科的热球仪微创治疗子宫出血，普外科的腹腔镜、胆道镜不开刀治疗胆结石，呼吸内科过敏性哮喘的过敏源检测和脱敏治疗，消化内科的食管曲张静脉套扎治疗上消化道大出血、食道球囊扩张支架治疗食道良性狭窄，肿瘤科开展的介入治疗、微波热疗，肾内科中西医结合治疗各种难治性肾病并开展血液透析治疗，儿科的中西医结合治疗小儿厌食、小儿哮喘、小儿腹泻，皮肤科采用中西医结合治疗老烂腿等。
　　在市内较有影响的专科有：市级重点专科一骨科，乳腺外科、神经内科、心内科、肾内科、消化内科、普外科、脑外科、儿科和市级重点建设专科一口腔科。
　　南通市第二人民医院走“科技兴院之路”，大力开展科研，教学活动。每年开展的新技术、新项目、新疗法近30项，科研项目3-5项，在各级各类杂志上公开发表或在学术会议上交流论文80篇左右。近两年，医院有一批科研项目、新技术项目获省、市、局科技奖，其中获省厅科技一等奖1项，新技术引进奖1项，市科技进步奖5项，局新科技奖8项，医院现有南通大学医学院兼职教授、讲师38名，每年接收各类医学院校实习生、基层医院进修生近百名，良好的教学环境和较高的教学水平赢得了广大医学院校，实习进修生的广泛赞誉。