我院始建于1950年，前身为昆明铁路局中心医院，2004年4月整体移交云南省卫生厅管理，更名为云南省第三人民医院，是目前昆明市官渡区唯一一所集医疗、教学、科研、健康管理、职业病诊治为一体的省级三级甲等综合医院。2008年6月挂牌大理学院附属昆明医院，2010年被确定为云南省省级公立医院综合改革试点医院。是云南省省级消防安全示范单位、昆明市餐饮服务食品安全A级单位。 目前医院拥有1个院士工作站：周宏灏院士工作站；多个专家工作站；1个省级研究中心：职业中毒救治临床诊疗研究中心；4个省级中心：云南省职业中毒救治中心、云南省企业职工体检中心、云南省临床营养质量控制中心、云南省职业病诊疗质控中心；4个培训基地：云南省妇科内镜诊疗技术培训基地、中华医学会疼痛学分会临床培训基地、国家级临床药师培训基地、云南省住院医师规范化培训基地；9个省级临床重点专科：职业病科、上海市肺科医院合作基地、临床护理、儿科、放射医学影像科、老年病科、消化内科、重症医学科、麻醉科；2个省院共建项目：职业病检测中心和血液净化科。医院与泰国清迈大学、上海同济大学附属肺科医院、上海市第十人民医院建立了长期合作关系；与全省16家医疗机构建立联盟医院合作；是国际应急管理学会医学委员会的合作单位；2016年，医院与华大基因、一心堂药业、新康医疗等多家国内、省内知名企业在基因工程、医药分离、社区医疗等领域建立了战略合作。 医院设有内、外、妇、儿、医技、护理等六个教研室，是云南省中医学院、云南大理大学的教学单位，拥有齐全的教学设施，建有中心实验室，教学、科研工作年年有新突破。 医院配置有先进齐全的大型医疗设备：平板数字减影血管造影系统（DSA）、磁共振成像系统(MRI)、螺旋CT、数字X线摄影系统（DR）、数字化乳腺X线摄影系统、乳房活检与旋切系统、数字化双能X线骨密度仪、动态大平板多功能X线诊断设备、数字化移动X线摄影系统、C型臂X光机、大型体检车、全数字化超高清晰度内镜系统、超声内镜、腹腔镜、椎间孔镜、手术显微镜、彩色多普勒超声诊断系统、全自动生化分析仪血液透析系统、全自动血细胞分析流水线、纳米半导体激光治疗系统、中央监护系统、下肢反馈康复机器人、盆底功能障碍康复治疗仪等。 医院参与“5.12汶川地震”、“4.14玉树地震”、“3.01昆明暴恐事件”、等突发公共事件的救灾。