北京水利医院始建于1978年，占地面积7492平方米，建筑面积12222.9平方米，编制床位300张，是一所医教研防、科室齐全、设备先进、技术优良、服务周到的二级甲等非营利性综合医院，分别与北京积水潭医院、解放军总医院、宣武医院、阜外医院、人民医院、北京世纪坛医院、北京大学口腔医院、唐山疼痛病医院建立医联体，为患者提供就诊绿色通道。北京密云水库医院隶属于北京水利医院。于2001年被北京市定为首批基本医疗保险定点医院，现隶属于北京市水务局。 目前全院共有职工603人，其中卫计人员505人，正高职称人员12人，副高职称人员31人，中级职称人员110人，其他技术人员21人，行政后勤人员77人。 医疗科室设有内科一病区、内科二病区、内科三病区、综合病区、创伤三病区、创伤四病区、创伤重症、外科共8个病区。门诊设有内科、外科、急诊科、感染科、骨科、创伤科、妇科、儿科、眼科、口腔科、耳鼻喉科、中医科、皮科、水务医疗办、针灸理疗科、预防保健科、体检科，社区卫生科（下设4个社区卫生服务站）。医技科室设有医学影像科（放射、CT、MRI）、药剂科、检验科、病理科、输血科、功能检查科、病案统计科、胃镜室。  近年来医院注重医疗设备的引进和投资， 现有万元以上大型医疗设备224台，其中包括：飞利浦核磁共振成像设备，西门子X线电子计算机断层扫描装置，以色列高分辨率数字成像系统（DR），数字化口腔全景CT,床旁X光机，全血自动化分析仪，全自动凝血分析仪，血小板聚集分析系统，微生物鉴定及药敏分析仪，动态血沉压积测试仪，全自动血培养仪,基因扩增仪HPV,恒温杂交仪HPV，液基薄层制片系统TCT,血栓弹力检测仪，全数字化彩色超声多普勒诊断仪，便携式彩色超声诊断系统，动态血压分析系统机，动态心电分析系统机，运动心肺功能测试系统，骨密度仪，脑电图仪，肌电图仪，超声乳化仪，眼科手术显微镜，免散瞳眼底照相仪，OCT机，眼底造影机，超声眼科专用诊断仪，YAG激光治疗仪，532激光光凝仪，德国科瓦牙科综合治疗椅，瑞典微创拔牙手术器械，美国口腔正畸器械，瑞士种植机，冷光美白机，德国根管治疗仪，平衡功能诊断治疗仪，纯音测听仪，眼震图仪，耳声阻抗测量仪，数字化关节镜系统，电子支气管镜，电子结肠镜系统，电子内窥镜系统，德国脑电意识深度监测系统，美国中央监护系统。