安徽中医药大学第二临床医学院（安徽省针灸医院、安徽中医药大学第二附属医院）创建于1985年，是全国最早成立、目前也是全国规模最大的集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的三级甲等针灸专科医院，是国家中医药管理局“中医药国际合作基地”、世界针灸学会联合会“临床基地”、国家中医药管理局“中医药标准化研究推广基地”、中国针灸学会“针灸标准化研究示范基地”、安徽省针灸临床国际联合研究中心，安徽省特色中医院，内设安徽省中医药科学院针灸临床研究所。
　　医院占地面积18790平方米，建筑面积51500平方米，设有23个临床科室，开放病区20个，医技科室9个，开放床位1016张。医院现有职工912人，高级职称113人，其中全国名中医1人、全国名老中医学术经验继承导师8人，全国中医药优秀临床人才5人，全国中药特色技术传承人才2人，安徽省国医名师3人，安徽省名老中医传承导师10人，江淮名医12人，安徽省名中医16人，安徽省学术和技术带头人1人，安徽省中医药领军人才1人，安徽省卫计委青年领军人才3人，硕士和博士研究生导师43人。
　　医院设有脑病、骨伤、推拿、脾胃、老年病、康复、心内、内分泌、呼吸、肿瘤、皮肤、肛肠、妇、男、儿、外、五官、眼、口腔、急诊、麻醉、重症等临床科室及治未病中心。拥有国家重点学科2个，国家临床重点专科3个，国家中管局重点专科 8个，安徽省中医药管理局重点专科7个、重点专病3个，国家名中医工作室4个，省名中医工作室13个。医院拥有核磁共振成像系统、多层螺旋CT、全自动生化分析仪等先进大型医疗仪器设备16台。拥有中医体质辨识系统、中药煎药包装机、中药制剂设备、中医推拿康复理疗设备等。
　　自2013年来，医院承担各级各类科研项目总数为232项，其中国家自然基金面上项目3项，青年基金2项，国家局标准化项目6项，省科技攻关项目5项，省科技计划项目4项，中央引导地方项目1项，省自然面上项目9项，省自然青年项目4项，教育厅重点项目18项，厅局级项目186项，近五年共获科研经费约600万元，其中自筹经费91.5万元。医院获省部级以上奖励11项，省部级研究成果5项。获得各级各类科技奖励及成果18项，获得各级各类专利38项。
　　医院荣获“安徽中医药大学先进集体”、“合肥市文明单位”等多项荣誉称号，2017年8月荣获“全国卫生计生系统先进集体”称号。2019年3月荣获国家卫生健康委财务司2017-2018年全国医疗服务价格和成本监测与研究网络“先进机构”称号。